Судя по схеме-на большой скорости со сканера и будет работать только 1 вент, так как на голубом проводе при включении 2й скорости не будет ничего,первая ж скорость со сканера в этот момент не включена, а коричнево-черный при 2й скорости заземлен. Принудително заземляйте коричнево-красный(управление 1й скоростью) и ТОЛЬКО ТОГДА со сканера пробуйте вторую скорость включить. Судя по "Запускаю вентиляторы со сканера: вентелятор 1 - работают оба с малыми оборотами.. запускаю вентелятор 2 - работает во всю мощь только левый" софт поддерживает раздельное включение, в него лезть не надо.